В първата директория (папка), в която влезете след като се логнете с FTP клиент или през web с файловия мениджър – ще се ориентирате по това, че там ще виждате папката „www“. Може да разположите .htaccess файла също и в папката „www“ или например ако става дума за поддомейн – в папка „root“, която се явява основна директория на поддомейните (subdomain/root/) и т.н. Apache server-a проверява постоянно във всички „higher-level“ директории.

Примери за разполагане на .htaccess файл:
/.htaccess
/www/.htaccess
/subdomain/.htaccess
/subdomain/root/.htaccess

Повече информация за работата с .htaccess може да прочетете на страница Какво е .htaccess файл и как да го ползвам?